Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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