Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Tulp2-209ENSMUST00000210813 2153 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms