Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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