Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms