Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col9a2Q07643 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms