Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Stx2Q00262 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms