Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gbx1P82976 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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