Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cd22-210ENSMUST00000189718 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Numb-204ENSMUST00000117217 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nell2-201ENSMUST00000075275 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ptger2-201ENSMUST00000046891 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nasp-202ENSMUST00000030457 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr214-203ENSMUST00000214699 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr214-204ENSMUST00000215846 2605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Vmn2r56-201ENSMUST00000163852 2340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm38059-201ENSMUST00000193746 1999 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Stambp-201ENSMUST00000068054 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gng7-202ENSMUST00000099462 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Spag8-201ENSMUST00000084646 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 AC113059.1-201ENSMUST00000181185 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 C6-203ENSMUST00000162350 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Trappc9-201ENSMUST00000023276 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms