Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CartptP56388 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms