Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sh3bp1P55194 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms