Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SftpbP50405 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms