Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl3P27659 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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