Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms