Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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