Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou3f1P21952 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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