Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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