Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt1P13864 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms