Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms