Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.8 ms