Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb3P09026 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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