Protein–RNA interactions for Protein: P01677

Ig kappa chain V-VI region TEPC 601/TEPC 191, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01677 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01677 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01677 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01677 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms