Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ifnb1P01575 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifnb1P01575 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms