Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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