Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lnx1O70263 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms