Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3298E9PW80 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms