Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprbB2RU80 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms