Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms