Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Lcn6A2AJB9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lcn6A2AJB9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms