Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms