Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms