Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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