Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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