Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms