Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sgms1Q8VCQ6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms1Q8VCQ6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms1Q8VCQ6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sgms1Q8VCQ6 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms1Q8VCQ6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms1Q8VCQ6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms1Q8VCQ6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sgms1Q8VCQ6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sgms1Q8VCQ6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sgms1Q8VCQ6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgms1Q8VCQ6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sgms1Q8VCQ6 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sgms1Q8VCQ6 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgms1Q8VCQ6 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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