Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms