Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc28aQ8CEI3 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms