Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms