Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rdh13Q8CEE7 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms