Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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