Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp40Q8BWR4 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp40Q8BWR4 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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