Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp54Q8BL06 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms