Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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PtprdQ64487 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprdQ64487 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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