Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifit1Q64282 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms