Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms