Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm28047Q3US59 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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