Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms