Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Edc4Q3UJB9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Edc4Q3UJB9 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms