Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd2Q149F1 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd2Q149F1 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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