Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Perm1Q149B8 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Perm1Q149B8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms