Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Srsf5-204ENSMUST00000110354 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms